《柔美的细胞小将第二季》故事延续前作，描写主人公细胞小将们在机体内面对新挑战。随着年龄增长，主人公身体出现更多健康问题，细胞小将们通过团结合作，与病毒、细菌等进行搏斗。同时，他们还要应对心理压力等问题，在成长路上互相支持。本季剧情更加紧凑精彩，让观众感受到健康与友爱的重要性。